Não sei se mais alguém teve este problema relacionado ao Fedora e ao Skype, mas aqui o programa chegava a travar a máquina, usando praticamente 100% do processador.
Como eu não usava muito o skype, deixei a coisa rolar. Mas como estou fazendo um curso que o contato principal da escola é o programa, acabei procurando a solução.
No meu caso aqui, é um problema em relação ao skype o pulse-audio, que por algum motivo bizarro, parece ganhar uma prioridade tão alta que o processador fica de posse do mesmo.
Primeiro, adicione o seu usuário aos grupos do pulse, conforme a imagem abaixo :
Para resolver o problema é só inserir as seguintes linhas no arquivo /etc/pulse/daemon.conf
high-priority = yes nice-level = -11 realtime-scheduling = yes realtime-priority = 5 resample-method = src-sinc-best-quality
E pronto, após um novo login, você tem o seu computador de volta ao usar o skype.