Dica rápida e bem interessante que achei aqui no disco rígido e que pode ajudar muita gente.
Tem o seu SSH rodando em outra porta e precisa urgente mandar um arquivo via sftp e não sabe ?
O comando é bem simples. Levemos em conta que o SSH está rodando na porta 9999.
O comando seria o seguinte:
$ sftp -oPort=9999 root@seuservidor.com.br
E pronto, está conectado ao seu servidor para passar seus arquivos.